医院手术室净化装修的建设成本非常高。一般来说，室内装修(墙壁、屋顶、地板、门、窗户等。)和空调净化系统(包括制冷空调设备和管道配件、净化设备和配件等。)在100级垂直单向流的洁净室中。;如纯水制备设备及系统管道、纯气发生及系统管道、废水处理设备及管道、消防系统、供配电及自动控制系统、真空清洗系统等，其单位面积建设投资成本高达几元/m2。

医院手术室净化装修的建设成本非常高。一般来说，室内装修(墙壁、屋顶、地板、门、窗户等。)和空调净化系统(包括制冷空调设备和管道配件、净化设备和配件等。)在100级垂直单向流的洁净室中。;如纯水制备设备及系统管道、纯气发生及系统管道、废水处理设备及管道、消防系统、供配电及自动控制系统、真空清洗系统等，其单位面积建设投资成本高达几元/m2。

由于医院手术室净化装修风量大，新风量大，对温湿度要求严格，因此空气热湿处理和空气输配能耗大，耗电多，运行成本高。由于科学技术的快速发展，高科技产品不断出现，尤其是电子工业的发展日新月异，比如集成电路的发展2~3年就更新了一代，这就要求为其服务的高级洁净室必须能够适应其发展速度，具有优异的灵活性和适应性。因为建医院手术室净化装修不会在一两年内拆除重建。因此，在设计和建造洁净厂房时，应考虑技术的发展和变化，并考虑洁净厂房的灵活性和适应性。